يحذر أطباء وخبراء تغذية من إهمال النظام الغذائي بعد الانتهاء من تناول المضادات الحيوية، مؤكدين أن هذه المرحلة لا تقل أهمية عن فترة العلاج نفسها، بل تُعد امتدادًا ضروريًا له لضمان فعالية التعافي واستعادة التوازن الداخلي للجسم. فالمضادات الحيوية، رغم قدرتها العالية على القضاء على البكتيريا المسببة للعدوى، تؤثر في المقابل على البكتيريا النافعة التي تعيش في الجهاز الهضمي، وتشكّل خط الدفاع الأول للمناعة، والهضم السليم، وامتصاص المغذيات. ويؤدي اختلال هذا التوازن الميكروبي إلى ظهور مشكلات هضمية مثل الانتفاخ، الإسهال، أو حتى التهابات فطرية مزعجة. وينصح الأطباء، بضرورة إدخال أطعمة غنية بالبروبيوتيك إلى النظام الغذائي، مثل الزبادي الطبيعي، الكفير، المخللات المخمرة، وبعض أنواع الجبن الطري، لدعم نمو البكتيريا النافعة. كما ينبغي تعزيز الألياف الطبيعية من مصادرها النباتية، كالبقول، الشوفان، الحبوب الكاملة، والخضراوات الورقية، كونها تُمثّل الغذاء المثالي للبروبيوتيك. ومن جانب آخر، يُنصح بالابتعاد عن الأغذية المسببة للالتهاب أو التي تُضعف الامتصاص، كالكحول، الجريب فروت، السكريات المكررة، والمنتجات التي تحتوي على الخميرة الزائدة. إن التعامل الواعي مع هذه الفترة، عبر التغذية المدروسة، يسرّع من التعافي، ويعيد للجسم توازنه البيولوجي، ويحميه من المضاعفات.